Towards an automated analysis of video-microscopy images of fungal morphogenesis
DOI:
https://doi.org/10.3989/ajbm.2005.v62.i1.33Palabras clave:
análisis automatizado, análisis de imágenes, crecimiento de hongos, hifa, modelo hifoide, morfogénesis, Saprolegnia, video-microscopíaResumen
La morfogénesis de los hongos es un área de estudio de gran relevancia en la biología celular y en la que se han desarrollado varios modelos matemáticos. Los modelos matemáticos de procesos biológicos precisan de pruebas experimentales que apoyen y corroboren las predicciones teóricas y, por este motivo, existe una búsqueda continua de nuevas técnicas de microscopía y análisis de imágenes para su aplicación en el estudio del crecimiento celular. En este trabajo hemos utilizado una técnica basada en un detector de contornos llamado “Canny-edge-detector” con el objetivo de automatizar la generación de perfiles de hifas y el cálculo de parámetros morfogenéticos, tales como: el diámetro, la velocidad de elongación y el ajuste con el perfil hifoide, es decir, el perfil teórico de las hifas de los hongos. Los resultados obtenidos son similares a los datos publicados a partir de técnicas manuales de trazado de contornos, generados en la misma especie y género. De esta manera demostramos que la aplicación de esta técnica para el trazado de perfiles en hifas en crecimiento es un método eficaz y preciso para el estudio de la morfogénesis de hifas. Este trabajo representa el primer paso en la automatización de análisis de imágenes de video-microscopía de morfogénesis de hifas.
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Publicado
2005-06-30
Cómo citar
Diéguez-Uribeondo, J., Hernández-Crespo, J. C., Cortés, R., López, F., & Pech, J. L. (2005). Towards an automated analysis of video-microscopy images of fungal morphogenesis. Anales Del Jardín Botánico De Madrid, 62(1), 101–107. https://doi.org/10.3989/ajbm.2005.v62.i1.33
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